Assessment Score

Here is the result of oligodyad-analysis in the motifi-finding assessment.


Data set	nTP	nFP	nFN	nTN	sTP	sFP	sFN	nSn	nPPV	nSp	nPC	nCC	sSn	sPPV	sASP
dm01g	0	135	125	5740	0	18	7	0	0	0.9770213	0	-0.0221301	0	0	0
dm02r	0	45	49	1906	0	3	5	0	0	0.9769349	0	-0.0240438	0	0	0
dm03m	0	32	104	5864	0	4	9	0	0	0.9945726	0	-0.0097252	0	0	0
dm04g	0	170	135	7695	0	27	9	0	0	0.9783853	0	-0.0193046	0	0	0
dm05g	0	108	160	7232	0	17	14	0	0	0.9852861	0	-0.0178461	0	0	0
dm06r	0	0	98	2902	0	0	7	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
dm07m	0	28	0	4472	0	4	0	NaN	0	0.9937778	0	NaN	NaN	0	NaN
dm08m	0	82	0	5918	0	11	0	NaN	0	0.9863333	0	NaN	NaN	0	NaN
hm01g	0	0	236	35764	0	0	16	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm02r	0	0	257	8743	0	0	11	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm03r	0	0	408	14592	0	0	15	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm04m	0	180	168	25652	0	22	11	0	0	0.9930319	0	-0.0067334	0	0	0
hm05r	12	27	181	2780	1	4	10	0.0621762	0.3076923	0.9903812	0.0545455	0.1138366	0.0909091	0.2	0.1454545
hm06g	0	0	75	4425	0	0	9	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm07m	7	35	120	4838	1	5	5	0.0551181	0.1666667	0.9928176	0.0432099	0.0826382	0.1666667	0.1666667	0.1666667
hm08m	68	20	122	7290	7	5	6	0.3578947	0.7727273	0.997264	0.3238095	0.5182615	0.5384615	0.5833333	0.5608974
hm09g	0	0	160	14840	0	0	10	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm10m	0	0	89	2911	0	0	11	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm11g	0	0	269	7731	0	0	19	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm12r	7	26	63	904	1	2	4	0.1	0.2121212	0.972043	0.0729167	0.1028992	0.2	0.3333333	0.2666667
hm13r	0	35	164	5801	0	5	9	0	0	0.9940027	0	-0.0128408	0	0	0
hm14r	0	16	82	1902	0	2	4	0	0	0.991658	0	-0.0185683	0	0	0
hm15r	0	0	90	7910	0	0	4	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm16g	0	0	164	20836	0	0	7	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm17g	63	12	82	5343	6	1	4	0.4344828	0.84	0.9977591	0.4012739	0.5971179	0.6	0.8571429	0.7285714
hm18m	0	167	88	14745	0	23	7	0	0	0.988801	0	-0.0081511	0	0	0
hm19g	0	0	87	2413	0	0	4	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm20r	0	0	1306	70694	0	0	76	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm21g	0	0	93	4907	0	0	7	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm22m	24	48	82	2846	2	10	3	0.2264151	0.3333333	0.983414	0.1558442	0.2531139	0.4	0.1666667	0.2833333
hm23r	9	27	134	1830	0	6	5	0.0629371	0.25	0.9854604	0.0529412	0.0937939	0	0	0
hm24m	0	0	92	3908	0	0	8	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
hm25g	0	33	70	897	0	5	5	0	0	0.9645161	0	-0.0506817	0	0	0
hm26m	0	72	247	8681	0	12	10	0	0	0.9917742	0	-0.0150855	0	0	0
mus01r	0	0	85	1415	0	0	6	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
mus02r	0	49	232	8719	0	7	12	0	0	0.9944115	0	-0.0120353	0	0	0
mus03g	7	21	135	2337	0	4	9	0.0492958	0.25	0.9910941	0.0429448	0.0888354	0	0	0
mus04m	14	74	250	6662	1	13	13	0.0530303	0.1590909	0.9890143	0.0414201	0.0718902	0.0714286	0.0714286	0.0714286
mus05r	0	0	88	1912	0	0	6	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
mus06g	17	19	50	1414	3	3	2	0.2537313	0.4722222	0.9867411	0.1976744	0.3245668	0.6	0.5	0.55
mus07g	0	98	100	5802	0	14	4	0	0	0.9833898	0	-0.016776	0	0	0
mus08m	0	49	41	4410	0	7	3	0	0	0.989011	0	-0.010061	0	0	0
mus09r	0	0	41	959	0	0	2	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
mus10g	6	58	217	12719	2	9	13	0.0269058	0.09375	0.9954606	0.0213523	0.0414929	0.1333333	0.1818182	0.1575758
mus11m	0	0	211	5789	0	0	15	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
mus12m	0	0	145	1355	0	0	7	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
yst01g	0	0	122	8878	0	0	7	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
yst02g	14	20	94	1872	2	3	3	0.1296296	0.4117647	0.9894292	0.109375	0.2081626	0.4	0.4	0.4
yst03m	44	21	103	3832	7	3	11	0.2993197	0.6769231	0.9945497	0.2619048	0.4373041	0.3888889	0.7	0.5444444
yst04r	0	49	131	5820	0	7	7	0	0	0.991651	0	-0.0135568	0	0	0
yst05r	0	24	72	1404	0	3	4	0	0	0.9831933	0	-0.0286329	0	0	0
yst06g	45	7	115	3333	5	1	2	0.28125	0.8653846	0.9979042	0.2694611	0.481939	0.7142857	0.8333333	0.7738095
yst07m	0	0	0	3000	0	0	0	NaN	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
yst08r	8	104	271	10617	0	15	14	0.0286738	0.0714286	0.9902994	0.0208877	0.0297152	0	0	0
yst09g	0	0	215	15785	0	0	13	0	NaN	1	0	NaN	0	NaN	NaN
yst10m	0	0	0	5000	0	0	0	NaN	NaN	1	NaN	NaN	NaN	NaN	NaN
Fly	0	600	671	41729	0	84	51	0	0	0.9858253	0	-0.0149773	0	0	0
Human	190	698	4929	283183	18	102	280	0.0371166	0.213964	0.9975412	0.0326629	0.0825991	0.0604027	0.15	0.1052013
Mouse	44	368	1595	53493	6	57	92	0.0268456	0.1067961	0.9931676	0.0219233	0.03947	0.0612245	0.0952381	0.0782313
Yeast	111	225	1123	59541	14	32	61	0.0899514	0.3303571	0.9962353	0.0760795	0.1639418	0.1866667	0.3043478	0.2455072
Total	345	1891	8318	437946	38	275	484	0.0398245	0.1542934	0.9957007	0.032689	0.0694201	0.0727969	0.1214058	0.0971013