Assessment Score
Here is the result of AlignACE in the motifi-finding assessment.
| Data set | nTP | nFP | nFN | nTN | sTP | sFP | sFN | | nSn | nPPV | nSp | nPC | nCC | sSn | sPPV | sASP |
|---|
| dm01g | 0 | 0 | 125 | 5875 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| dm02r | 0 | 0 | 49 | 1951 | 0 | 0 | 5 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| dm03m | 0 | 110 | 104 | 5786 | 0 | 10 | 9 | | 0 | 0 | 0.9813433 | 0 | -0.01815 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| dm04g | 0 | 0 | 135 | 7865 | 0 | 0 | 9 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| dm05g | 0 | 0 | 160 | 7340 | 0 | 0 | 14 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| dm06r | 0 | 0 | 98 | 2902 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| dm07m | 0 | 0 | 0 | 4500 | 0 | 0 | 0 | | NaN | NaN | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN
|
|---|
| dm08m | 0 | 0 | 0 | 6000 | 0 | 0 | 0 | | NaN | NaN | 1 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN
|
|---|
| hm01g | 0 | 0 | 236 | 35764 | 0 | 0 | 16 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm02r | 0 | 190 | 257 | 8553 | 0 | 19 | 11 | | 0 | 0 | 0.9782683 | 0 | -0.0251782 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| hm03r | 0 | 182 | 408 | 14410 | 0 | 14 | 15 | | 0 | 0 | 0.9875274 | 0 | -0.0185316 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| hm04m | 1 | 164 | 167 | 25668 | 0 | 15 | 11 | | 0.0059524 | 0.0060606 | 0.9936513 | 0.003012 | -0.0003999 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| hm05r | 0 | 0 | 193 | 2807 | 0 | 0 | 11 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm06g | 0 | 0 | 75 | 4425 | 0 | 0 | 9 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm07m | 0 | 0 | 127 | 4873 | 0 | 0 | 6 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm08m | 74 | 36 | 116 | 7274 | 8 | 3 | 5 | | 0.3894737 | 0.6727273 | 0.9950752 | 0.3274336 | 0.5026533 | 0.6153846 | 0.7272727 | 0.6713287
|
|---|
| hm09g | 0 | 0 | 160 | 14840 | 0 | 0 | 10 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm10m | 0 | 192 | 89 | 2719 | 0 | 16 | 11 | | 0 | 0 | 0.9340433 | 0 | -0.0457221 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| hm11g | 0 | 0 | 269 | 7731 | 0 | 0 | 19 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm12r | 0 | 0 | 70 | 930 | 0 | 0 | 5 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm13r | 0 | 0 | 164 | 5836 | 0 | 0 | 9 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm14r | 0 | 0 | 82 | 1918 | 0 | 0 | 4 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm15r | 0 | 0 | 90 | 7910 | 0 | 0 | 4 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm16g | 0 | 0 | 164 | 20836 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm17g | 88 | 12 | 57 | 5343 | 9 | 1 | 1 | | 0.6068966 | 0.88 | 0.9977591 | 0.5605096 | 0.7250617 | 0.9 | 0.9 | 0.9
|
|---|
| hm18m | 0 | 0 | 88 | 14912 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm19g | 0 | 0 | 87 | 2413 | 0 | 0 | 4 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm20r | 0 | 458 | 1306 | 70236 | 0 | 43 | 76 | | 0 | 0 | 0.9935214 | 0 | -0.0108751 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| hm21g | 0 | 0 | 93 | 4907 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm22m | 0 | 0 | 106 | 2894 | 0 | 0 | 5 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm23r | 0 | 0 | 143 | 1857 | 0 | 0 | 5 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm24m | 34 | 256 | 58 | 3652 | 4 | 25 | 4 | | 0.3695652 | 0.1172414 | 0.9344933 | 0.0977011 | 0.1757691 | 0.5 | 0.137931 | 0.3189655
|
|---|
| hm25g | 0 | 0 | 70 | 930 | 0 | 0 | 5 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| hm26m | 4 | 269 | 243 | 8484 | 1 | 20 | 9 | | 0.0161943 | 0.014652 | 0.9692677 | 0.0077519 | -0.013849 | 0.1 | 0.047619 | 0.0738095
|
|---|
| mus01r | 0 | 78 | 85 | 1337 | 0 | 6 | 6 | | 0 | 0 | 0.9448763 | 0 | -0.0574022 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| mus02r | 0 | 0 | 232 | 8768 | 0 | 0 | 12 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| mus03g | 40 | 116 | 102 | 2242 | 3 | 6 | 6 | | 0.2816901 | 0.2564103 | 0.9508058 | 0.1550388 | 0.2224796 | 0.3333333 | 0.3333333 | 0.3333333
|
|---|
| mus04m | 0 | 154 | 264 | 6582 | 0 | 14 | 14 | | 0 | 0 | 0.9771378 | 0 | -0.0296922 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| mus05r | 0 | 0 | 88 | 1912 | 0 | 0 | 6 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| mus06g | 0 | 90 | 67 | 1343 | 0 | 9 | 5 | | 0 | 0 | 0.9371947 | 0 | -0.0546293 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| mus07g | 0 | 0 | 100 | 5900 | 0 | 0 | 4 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| mus08m | 0 | 130 | 41 | 4329 | 0 | 10 | 3 | | 0 | 0 | 0.9708455 | 0 | -0.0165388 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| mus09r | 0 | 0 | 41 | 959 | 0 | 0 | 2 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| mus10g | 0 | 180 | 223 | 12597 | 0 | 18 | 15 | | 0 | 0 | 0.9859122 | 0 | -0.0156542 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| mus11m | 7 | 163 | 204 | 5626 | 0 | 17 | 15 | | 0.0331754 | 0.0411765 | 0.9718432 | 0.0187166 | 0.0055713 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| mus12m | 0 | 0 | 145 | 1355 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| yst01g | 0 | 182 | 122 | 8696 | 0 | 13 | 7 | | 0 | 0 | 0.9794999 | 0 | -0.0168412 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| yst02g | 0 | 0 | 108 | 1892 | 0 | 0 | 5 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| yst03m | 0 | 108 | 147 | 3745 | 0 | 9 | 18 | | 0 | 0 | 0.9719699 | 0 | -0.0325375 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| yst04r | 35 | 85 | 96 | 5784 | 4 | 8 | 3 | | 0.2671756 | 0.2916667 | 0.9855171 | 0.162037 | 0.2637735 | 0.5714286 | 0.3333333 | 0.452381
|
|---|
| yst05r | 0 | 0 | 72 | 1428 | 0 | 0 | 4 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| yst06g | 0 | 0 | 160 | 3340 | 0 | 0 | 7 | | 0 | NaN | 1 | 0 | NaN | 0 | NaN | NaN
|
|---|
| yst07m | 0 | 80 | 0 | 2920 | 0 | 8 | 0 | | NaN | 0 | 0.9733333 | 0 | NaN | NaN | 0 | NaN
|
|---|
| yst08r | 108 | 321 | 171 | 10400 | 9 | 29 | 5 | | 0.3870968 | 0.2517483 | 0.9700588 | 0.18 | 0.2900617 | 0.6428571 | 0.2368421 | 0.4398496
|
|---|
| yst09g | 86 | 57 | 129 | 15728 | 8 | 5 | 5 | | 0.4 | 0.6013986 | 0.996389 | 0.3161765 | 0.4849361 | 0.6153846 | 0.6153846 | 0.6153846
|
|---|
| yst10m | 0 | 176 | 0 | 4824 | 0 | 11 | 0 | | NaN | 0 | 0.9648 | 0 | NaN | NaN | 0 | NaN
|
|---|
|
|
|---|
| Fly
| 0 | 110 | 671 | 42219 | 0 | 10 | 51 | | 0 | 0 | 0.9974013 | 0 | -0.0063762 | 0 | 0 | 0
|
|---|
| Human
| 201 | 1759 | 4918 | 282122 | 22 | 156 | 276 | | 0.0392655 | 0.102551 | 0.9938037 | 0.0292236 | 0.0531478 | 0.0738255 | 0.1235955 | 0.0987105
|
|---|
| Mouse
| 47 | 911 | 1592 | 52950 | 3 | 80 | 95 | | 0.028676 | 0.0490605 | 0.9830861 | 0.0184314 | 0.0152885 | 0.0306122 | 0.0361446 | 0.0333784
|
|---|
| Yeast
| 229 | 1009 | 1005 | 58757 | 21 | 83 | 54 | | 0.1855754 | 0.1849758 | 0.9831175 | 0.1020954 | 0.1684257 | 0.28 | 0.2019231 | 0.2409615
|
|---|
| Total
| 477 | 3789 | 8186 | 436048 | 46 | 329 | 476 | | 0.0550618 | 0.1118143 | 0.9913854 | 0.0383071 | 0.0658602 | 0.0881226 | 0.1226667 | 0.1053946
|
|---|